Datorita consecintelor negative pe careo au bolile care se transmit prin samanta, sunt necesare masuri severe de protectie fitosanitara. Amplasarea loturilor pentru samanta se face numai in zonele in care agentii fitopatogeni specifici pentru o anumita cultura nu se manifesta pentru zona respectiva. Chiar si in cadrul zonelor foarte favorabila, zonelor optime se vor evita terenurile joase precum si terenurile cu exces de umiditate care ar putea favoriza atacul unor agenti fitopatogei. Se vor evita monoculturile precum si plantele premergatoare care pot avea boli comune. Toate lucrarile fie cele de baza fie cele de intretinere trebuie efectuate in epoca optima pentru a se evita pe cat posibil o concordanta intre faza critica a plantei si momentul optim de atac a patogenului sau daunatorului. In timpulperioadei de vegetatie se vor efectua controale periodice a starii fitosanitare pentru a se identifica eventualii agenti patogeni. Controlul fitosanitar urmareste intr-o prima etapa gradul de extindere a atacului si daca atacul nu este identificat in mai multe focare se poate proceda la eliminarea acestor focare dinlan inainte de recoltare iar daca focarele cuprind intreaca cultura se elimina lanul de la recunoastere. La fiecare conrol se determina gradul de atac prin acordarea de note de la 1-5,pentru fregventa, pentru intensitatea de mansifestare si dupa care se calculeaza valorilemedii ale gradului de atac.
O resto si pe aver rig